27 ноября 1991 г. по постановлению Правительства РФ был создан Поволжский кадровый центр, в 1995 г. распоряжением Президента Российской Федерации переименованный в Поволжскую академию государственной службы; в 2002 г. ей присвоено имя выдающегося государственного деятеля России Петра Аркадьевича Столыпина.

ПАГС включал пять факультетов; институт переподготовки и повышения квалификации кадров государственной службы и местного самоуправления; системы довузовского и послевузовского образования; учебные, исследовательские, экспертный, консалтинговый и издательский центры, центр качества образования и инновационного развития, центр развития творчества студентов.

Факультет государственного и муниципального управления начал свою деятельность в 1992 г. и являлся ведущим в академии.  Подготовка велась по шести специальностям: «Государственное и муниципальное управление», «Документоведение и документационное обеспечение управления», «Таможенное дело», «Организация работы с молодежью», «Управление персоналом», «Прикладная информатика (в управлении)».

Учебный процесс на факультете обеспечивали девять кафедр, в том числе семь выпускающих. Из 150 преподавателей, работавших на факультете, 36 являлись профессорами и 82 – доцентами.

Факультет политико-правового управления создан в 1998 году. Подготовка велась по четырем специальностям: «Политология», «Юриспруденция», «Связи с общественностью», «Регионоведение» и двум направлениям подготовки: «Юриспруденция» и «Конфликтология».

В структуру факультета входили девять кафедр, шесть из которых являлись выпускающими. На кафедрах факультета работали высококвалифицированные специалисты: доктора (13%),  кандидаты наук (70%).

Факультет экономики и управления начал функционировать как самостоятельное структурное подразделение в 1998 г., выпуская специалистов, востребованных российской экономикой. Учебными планами предусматривалась подготовка бакалавров по направлению «Менеджмент» и специалистов по специальностям: «Антикризисное управление», «Бухгалтерский учет, анализ и аудит», «Маркетинг», «Менеджмент организации», «Налоги и налогообложение», «Экономика и управление на предприятии (операции с недвижимым имуществом)». На восьми кафедрах факультета, в том числе пяти выпускающих, работали высококвалифицированные специалисты, среди них 12 докторов наук, профессоров и 59 кандидатов наук, доцентов.

Факультет второго высшего профессионального образования был организован в 2001 г. с целью подготовки и переподготовки квалифицированных специалистов управленческого, юридического и экономического профиля. Обучение велось по семи специальностям: «Государственное и муниципальное управление», «Юриспруденция», «Менеджмент организации», «Управление персоналом», «Бухгалтерский учет, анализ  и  аудит», «Антикризисное управление», «Экономика и управление на предприятии отрасли».

Обучение по программам среднего профессионального образования началось в академии с 1999 г. в рамках Института местного самоуправления по двум специальностям: «Правоведение» и «Государственное и муниципальное управление». В 2000 г. из Института местного самоуправления выделился колледж как структурное подразделение академии и была открыта специальность «Менеджмент». В 2003 г. на его базе создан факультет среднего профессионального образования. Обучение на факультете велось также по специальностям: «Правоведение», «Экономика и бухгалтерский учет (по отраслям)».

Факультет служил первой ступенью профессионального образования. Более 85% выпускников продолжали обучение в ПАГС по сокращенным программам высшей школы, реализуя концепцию непрерывного  профессионального образования.

Профессиональная переподготовка и повышение квалификации государственных и муниципальных служащих, руководителей и специалистов отраслей народного хозяйства субъектов РФ, прежде всего Поволжского региона, осуществлялись в академии на базе института переподготовки и повышения квалификации кадров государственной службы и местного самоуправления (ИППК) и учебно-делового центра Морозовского проекта. Ежегодно в системе дополнительного профессионального образования обучались более двух тысяч человек. На основе качественно новых подходов к содержанию дополнительного профессионального образования в ИППК реализовывалось более шестидесяти программ.

С 1998 г. институт был участником Президентской программы переподготовки управленческих кадров для организаций народного хозяйства Российской Федерации «Менеджер XXI века».

Поволжская академия государственной службы имени П.А. Столыпина являлась многоуровневой и многопрофильной межрегиональной образовательной системой, включавшей головной вуз в  Саратове и пять филиалов в Саратовской (Балаково, Балашов), Тамбовской (Тамбов), Ульяновской (Ульяновск) и Самарской (Тольятти) областях.

Научная деятельность академии была нацелена на создание практикоориентированных разработок, помогающих  развитию и укреплению кадрового потенциала органов власти и управления Поволжского региона. Взаимодействие с органами государственной власти и органами местного самоуправления  являлось непременным условием научной деятельности академии, способствовало интеграции теории и практики управления.

В академии функционировал институт кураторства, активно действовали  органы студенческого самоуправления.  Модель органов студенческого самоуправления ПАГС была признана лучшей на Всероссийском конкурсе Министерства образования и науки РФ в 2006 г. Студенческое кадровое агентство «Комильфо» стало победителем на областном конкурсе 2006 г.С 2001 г. начал издаваться журнал «Вестник Поволжской академии государственной службы», включенный в перечень ведущих рецензируемых научных журналов и изданий, рекомендованных ВАК РФ для опубликования основных результатов диссертационных исследований.

ПАГС как центр Международного форума государственного управления и менеджмента, поддерживал тесные партнерские связи с вузами и иными образовательными учреждениями Германии, Франции, Италии, Бельгии, Нидерландов, Болгарии, Венгрии, Словакии, США, Канады, Узбекистана. Совместно с зарубежными специалистами ученые академии принимали активное участие в разработке и реализации международных проектов по проблемам государственного и муниципального управления в рамках программ ЕС, Государственного департамента США, Немецкой службы академических обменов, Всемирного банка, различных фондов и организаций, финансирующих данные проекты.

Библиотека – важное звено в  обеспечении учебного процесса и научных исследований. Библиотечный фонд ПАГС  (насчитывал около 260 000 единиц хранения разнообразной учебной и научной литературы, электронных носителей информации, 300 наименований журналов и газет) – это уникальное собрание литературы по проблемам государственного и муниципального управления, современного управления рыночной экономикой. Библиотека располагала тремя читальными залами, абонементом учебной, научной и художественной литературы и являлась координирующим методическим центром для пяти библиотек филиалов академии.

В центре развития творчества студенты и аспиранты могли реализовывать творческие способности, воплощать в жизнь смелые идеи и фантазии, учиться актерскому мастерству, демонстрировать вокальные, художественные и хореографические таланты, проявлять себя в качестве авторов, режиссеров, актеров. Ни один городской и областной праздник не обходился без участия творческих сил академии. Студенческий клуб ПАГС – один из признанных лидеров областного фестиваля «Студенческая весна», неоднократный обладатель его высшей награды – Гран-при.